中法战争结束后，他带兵驻守滇缅边界，功绩显著，🃄🕑升任都司衔蓝翎守备🏹。🗼♒
光🍞🉑绪二十六年(1900年)，在浙江一带，为浙江巡抚刘树棠及省防统领🗼♒李庆堂所器重，委为两浙新中军左营管带，镇守三门湾，剿办宁波、温州、台⛑🙨🌻州一带“海匪”。
辛亥革命⚪🔌⚱爆发，黎天才🅓驻守上海吴淞，革命🜃⛆😈党人争取他起义反清，他积极响应。与其他起义军和上海民众一起光复上海及附近地区，任沪军都督府吴淞军政分府水陆军统领。
随后，他与各地起义军统领到镇江商讨会攻南京，🔘🀸🁠组成攻宁总司令部。十一月十四日他率沪淞军从上海奔赴南京，迅速攻占南京外围乌龙、莫府两山🄊，为攻取南京创造了有利条件。
南京攻克后，他被推举为江南第一镇统制，留守湖北，任江南⚵留鄂第一师师长，授陆军中将、二等文虎章、二等嘉禾章。
一九一五被任命为襄郧镇守使、陆军第十一师师🁃🃆长。次年改任陆🚊👨军第九师师长兼襄（阳）、郧（西🀙）镇守使。
这是一位从农民到将军的爱国将领。
王占元虽然不对自主军进攻，但是湖🇳🜥北西部还有另一支属于皖系的军队，那就是由四川败退到宜昌的吴光新军。
吴光新在四川打了败仗，很想收复荆、🆦👱🌪襄，立功赎罪。他的力量虽🐨🏩不强大，可是荆、襄两地自主军在地形上互相隔离，并且各自为政，互不配合，便于敌方各个击破。
王占元自己不愿进攻自🅓主军，也不🂹📩🝢愿假手别人，🁃🃆尤其是吴光新。他深知，倘若吴光新剿平了自主军，对他是有更大的威胁。
只是他不能公🄵开🕄反对吴光新对自主军的进兵，处境也更为尴尬。
河南汝州的自主更增加了问题的复杂性，河南督军赵倜虽名列主战🐨🏩派，可是他不是北洋派的正统，汝州在河南西南部，与湖北西北部👠襄樊毗连，如果两个地区的自主军合流，对赵倜也是一种威胁。
荆、襄自主也使桂系很伤脑筋，尤其是援湘的联帅谭浩明。因为湘西的民军纷纷要求开往鄂西，和自主军联成一片，谭浩明没有理由予🕓以拒绝。
可是🜪湘西民军开往鄂西，便是对王占元的一种敌对行动，王占元是北洋派中的主和派，因此他🀜又不能不竭力加以阻止。
他于是致电北京政府说：“如果🖂🏷北军攻荆、襄，则南🃄🕑军也会进攻岳🐨🏩州。”
这时，北军第三师已经开到广水，准🇳🜥备进攻湖南。