中法战争结束后👾🎠💛，他带兵驻守滇缅边界，功绩显著，升任都司衔蓝翎守备。
光绪二十六年(1900年)，在浙江一带，为浙🁻江巡抚刘树棠及省防统领李庆堂所器重，委为两浙新中军左营管带，镇守三门湾，剿办宁波、温州、台州一带“海匪”。
辛亥革命爆发，黎天才驻守上海吴淞，革命党人争取他起义反清，他积极😸🆋🍽响应。与其他起义军和上🞒📢🜞海民众一起光复上海及附近地区，任沪军都督府吴淞军政分府☡水陆军统领。
随后，他与各地起义军统领到镇江商讨会攻南京，组成攻宁总司令部。十一月十四日他率沪淞军从上海奔赴南京，迅速攻占南京外围乌龙、莫府两山，为攻取南京创造了有利条件。
南京攻克后，他被推举为江南第一镇统制，留守湖北，任江南留鄂第一师师长，授陆军中🇮🛼⚈将、二等文虎章、二等嘉禾章。
一😷🆄九🗿♮一五被任命为襄郧镇守使、陆军第十一师师长。次年改任陆军第九师师长兼襄（阳）、郧（西）镇守使。
这是一位从农民到将军的爱国将领。
王占元虽然不对自主军进攻，但😖🁖是湖北西部还有另一支属于皖系的军队，那就是由四川败退到宜昌的吴光新军。👦🖢
吴光新在四川打了败仗，很想收复荆、襄，立功赎罪。♵🌮他的力量虽不强大，可是荆、襄两地自主军在地形上互相👦🖢隔离，并且各🈬自为政，互不配合，便于敌方各个击破。
王占元自己不愿进攻自主军，也不愿假手别人，尤其是吴光新。他🁙🆌🎇深知，倘若吴光🉥新剿平了自主军，对他是有⛩更大的威胁。
只是🗿♮他不能公开反对吴光新对自主军的🙨🌻进兵🞶，处境也更为尴尬。
河南汝州的自🗙主更增加了问题的复杂性，河南督军赵倜虽名列主战派，可是他不是北洋派的正统，汝州在河南西南部，与湖北西北部襄樊毗连，如果两个地区的自主军合流，对赵倜也是一种威胁。
荆、襄自主也使桂系很伤脑筋，😖🁖尤其是援湘的联帅谭浩明。因为湘西的民军纷⛩纷要求开往鄂西，和自主军联成一片，谭浩明没有理由予以拒绝。
可是湘西民军开往鄂西，便是对王占元的一种敌对行动，王占元是北洋派中的主和🉥派，因此他又不能不竭力加以阻止。
他于是致电🖽😇北京政府说：“📒🚔📆如果北军攻荆、襄，则🁻南军也会进攻岳州。”
这时，北军第三师已经开到广水，准备进攻湖南🄟。